En un mundo de fantasía y ensueño ha nacido una nueva profesión, la de los Cazadores, valientes aventureros encargados de encontrar y capturar tesoros, recompensas y villanos. Para formarlos existen las escuelas de Cazadores, donde los jóvenes aprendices desarrollan sus habilidades. Los que se esfuerzan y consiguen graduarse se convierten en famosos cazadores y en un ejemplo para todos los niños del mundo. Uno de esos jóvenes alumnos es Gon, un muchacho con el corazón de oro ilusionado por convertirse en un Cazador y que se convertirá en una auténtica leyenda. Pero Gon sólo tiene un sueño, encontrar a su padre desaparecido años atrás.

La imprudente indiferencia de Edward y Alphonse Elric por las leyes fundamentales de la alquimia le arrancaron la mitad de las extremidades a Ed y dejaron el alma de Al pegada a una fría armadura. Para restaurar lo que se perdió, los hermanos recorren una tierra devastada por la guerra para la Piedra Filosofal, una reliquia legendaria que otorga la capacidad de realizar la alquimia de maneras imposibles. Los Elrics no están solos en su búsqueda; el corrupto Estado Militar también está ansioso por aprovechar el poder del artefacto. También lo son los extraños Homúnculos y su oscuro creador. La gema mítica atrae a los alquimistas exóticos de reinos distantes, dejando cicatrices profundas que inspiran el asesinato. A medida que los Elrics encuentran su curso alterado por estos enemigos y aliados, su propósito permanece inalterado, y su vínculo es irrompible.

La trama de la serie tiene lugar después de la batalla contra Pequeño Buu en medio del período de 10 años hacia el Torneo Mundial de las Artes Marciales 28. Está enlazada con las películas Dragon Ball Z: La Batalla de los Dioses y Dragon Ball Z: La Resurrección de F. La historia comienza a finales del Año 774, seis meses después de la derrota de Buu. La actual saga de Trunks del Futuro Alternativo ocurre el Año 780.

Es la continuación de la serie de anime 'Dragon Ball'. Se divide básicamente en cuatro sagas: la llegada de los Saiyajins, la batalla contra Freezer, el nacimiento de Cell y el despertar de Majin Buu. De éstas se desprenden subsagas y algunas otras historias que no son originales del manga.

Hace 140 años en el caos del Bakumatsu hubo un imperialista en Kyoto apodado "Battousai el Destajador". Asesinó personas en matanzas y abrió el camino a la nueva era Meiji. Era el más fuerte Battousai, sin embargo él desapareció misteriosamente cuando el caos llegó a un final. Aunque se desconoce su paradero. Battousai el Destajador se convirtió en una leyenda.